Douze ans après les événements relatés dans le premier épisode du cycle de Dune, Paul "Muad'Dib" Atreides règne sur l'Imperium après un jihad qui a vu ses fidèles Fremens répandre sa religion à travers l'univers et abattre ses ennemis. Mais la fin approche pour le fils du duc Leto, une fin qu'il va précipiter. Ce deuxième épisode de la saga traite principalement deux thèmes : d'une part le pouvoir de prescience de Paul, ses limites et ses dangers ; d'autre part la religion comme pilier et outil d'un gouvernement. "Prenez garde au chaos de la démocratie", s'exclame Alia, la propre soeur de l'Empereur !